A lényeges különbség a bérszámfejtők és könyvelők fogalmai között, hogy amíg a könyvelő munkája nagy részében a kimenő és bejövő számlák lekönyvelésével, addig a bérszámfejtő leginkább a munkavállalói fizetések körüli teendőkkel foglalkozik.

A könyvelő feladata a külső ügyfelek pénzügyeinek kezelése, a bérszámfejtőé pedig a belső munkatársak pénzügyeinek kézben tartása.